تسلسل البومبي والمبسي وتصنيف المتغيرات

هل يمكن أن يتغير تصنيف المتغير؟

يتم اكتشاف معلومات جديدة عن المتغيرات المسببة للأمراض كل يوم، ونتيجة لذلك، فإن عملية تفسير المتغيرات وتصنيفها مهمة مستمرة. ويستخدم مركز مكافحة الأمراض والوقاية منها طرقًا تقوم بالبحث عن هذه المعلومات الجديدة أسبوعيًا، وبمجرد تحديدها يتم تحديد أهميتها السريرية. سيراقب مركز دبي للسلع والخدمات الاستهلاكية والإلكترونية أي تغييرات مهمة سريريًا في التصنيف ويبلغ عنها من خلال إصدار تقرير معدل. عندما تتوافر معلومات جديدة مهمة سريرياً، هناك ثلاثة أنواع من تعديلات تصنيف المتغيرات التي يمكن أن تحدث:

• التعديل الحميد هو أي تغيير في تصنيف المتغير يحافظ على التفسير نحو الأهمية الحميدة أو يعززه. هذه هي أكثر أنواع التغييرات شيوعًا الناتجة عن المراقبة طويلة المدى لتصنيف المتغيرات.
• التعديل المُمْرِض هو أي تغيير في تصنيف المتغير يحافظ على التفسير نحو الأهمية الإمراضية أو يعززه.
• انعكاس التصنيف هو أي تغيير في تصنيف المتغير يتعارض مع التصنيف الذي تم الإبلاغ عنه سابقاً. إن عكس التصنيفات أمر نادر الحدوث نظرًا لمستوى وجودة الأدلة المطلوبة لاستيفاء تصنيفات أكثر تحديدًا.

ما مدى دقة تصنيف المتغير؟

يعكس التصنيف الذي تم الإبلاغ عنه للمتغير إجماع على جميع المعلومات المتاحة حاليًا لبرنامج فحص حديثي الولادة في وقت اكتشاف المتغير. تتطلب عملية تحديد التصنيف من خلال تقييم تلك المعلومات وجود خطوط متعددة من الأدلة بالاتفاق. مع زيادة خطوط الأدلة، تزداد ثقتنا في الأهمية السريرية للمتغير، مما يؤدي إلى تحويل التصنيف من غير معروف إلى محتمل حتى يتمكن العلماء من الوصول إلى تصنيف نهائي سواء كان حميدًا أو مسببًا للأمراض. عند اتباعها بشكل صحيح، تشير الإرشادات المهنية إلى احتمال بنسبة 90٪ المرتبط بتصنيفات " المحتملة " [1، 2].

المراجع:

1. ريتشاردز س، عزيز ن، بيل س، وآخرون. المعايير والمبادئ التوجيهية لتفسير المتغيرات التسلسلية: توصية توافقية مشتركة للكلية الأمريكية لعلم الوراثة الطبية وعلم الجينوم الطبي ورابطة علم الأمراض الجزيئية. جينيت ميد. 2015؛17(5):405-424.10.1038/ جيم .2015.30
2. Harrison, S. M., & Rehm, H. L. (2019). هل "ممرض محتمل" حقًا 90% محتمل؟ بيانات إعادة التصنيف في ClinVar. طب الجينوم، 11(1)، 72. doi:10.1186/ s / s13073-019-0688-9

تلقى طفلي التسلسل ولكن لم يتم العثور على متغيرات/طفرات. ماذا يعني هذا؟

تحدد عملية تحديد التسلسل لاضطرابات التخزين الليزوزومية المتغيرات النادرة داخل الجين المسبب للاضطراب الذي تم فحصه. يُعرّف مركز القيادة والتحليل الوراثي للسكري والاضطرابات العصبية النادرة بأنها تلك التي توجد في أقل من 5% من السكان. عندما يتم الإبلاغ عن نتيجة "لم يتم العثور على متغيرات" ، فهذا يعني أنه لم يتم تحديد أي متغيرات نادرة، سواء كانت مسببة للأمراض أو حميدة، داخل الجين المسبب للمرض المرتبط. في حدود الشاشة يمكننا القول أنه لم يتم العثور على مؤشرات معروفة للاضطراب الذي تم فحصه.

الهدف من فحص حديثي الولادة هو تحديد الرضع الذين تشير نتائجهم إلى زيادة خطر الإصابة بالمرض. وتزيد إضافة التسلسل من المستوى الثاني من خصوصية الفحص من خلال إلقاء نظرة فاحصة على مجموعة فرعية من الرضع الأكثر عرضة للخطر لتصفية أولئك الذين لا توجد لديهم خصائص وراثية معروفة للاضطراب.

ماذا يعني تصنيف الأهمية غير المؤكدة؟

يتم تطبيق تصنيف ذو أهمية غير مؤكدة على المتغير الذي لا توجد معلومات كافية أو متضاربة حول دور المتغير في المرض. كلما تم اكتشاف المزيد من المعلومات حول هذا المتغير، عادةً كنتيجة للأبحاث ونتائج المرضى، تكون المختبرات قادرة على تقديم تصنيف أكثر إفادة. قد يتقرر أو لا يتقرر أن يكون هذا المتغير ذو أهمية سريرية في وقت لاحق، لذلك يتم إحالة جميع الأطفال الذين يكتشف برنامج فحص حديثي الولادة وجود متغير غير مؤكد الأهمية لديهم إلى أخصائيي الوراثة لتقييمه.

ما هو التقرير المعدل؟

يتم إصدار تقرير معدل من قبل مختبر الفحص عند حدوث تغيير في نتائج الفحوصات المخبرية. بالنسبة لنتائج تحليل المتغيرات على وجه التحديد، تُعلمك التقارير المعدلة بالتغيير الذي طرأ على تصنيف المتغير بسبب البيانات العلمية المحدثة.
يكتشف مجتمع الأمراض الوراثية باستمرار معلومات جديدة عن المتغيرات المسببة للأمراض. ونتيجة لذلك، يعد تفسير المتغيرات وتصنيفها عملية متطورة. عندما يصنف مركز مكافحة الأمراض والوقاية منها (DCLS) متغيرًا ما، يتم تصنيفه بناءً على إجماع جميع المعلومات العلمية والطبية المتاحة حاليًا لدى المركز في ذلك الوقت. ومع اكتشاف معلومات جديدة وتقييمها، يمكن أن يؤدي ذلك إلى تغييرات في التصنيف قد تكون لها أهمية سريرية. يسلط الجدول التالي الضوء على الأنواع الثلاثة من التعديلات وتغييرات التصنيف المحتملة:

يلتزم برنامج فحص حديثي الولادة في فرجينيا بضمان أدق تصنيفات المتغيرات لاضطرابات حديثي الولادة التي يفحصها مركز فحص الأطفال حديثي الولادة. على هذا النحو، سنصدر تقارير معدلة لكل من مقدم التقرير الأصلي ومقدم الرعاية المسجل لأي تغيير في تصنيف المتغير.

قد يؤدي التعديل إلى تغيير التفسير العام للنتائج السابقة. يجب أن يتم تقييمها من قبل مقدم الرعاية بشكل تراكمي مع جميع البيانات المتغيرة التي تم الإبلاغ عنها للمريض.