SARS-COV2 تسلسل الجينوم الكامل
المختبر: التسلسل والمعلوماتية الحيوية
وصف الاختبار: تحديد نسب SARS-CoV-2 من خلال تسلسل الجينوم الكامل
هذا الاختبار مخصص للإبلاغ عن سلالات فيروس سارس-COV-2 التي تعتبرها مراكز مكافحة الأمراض والوقاية منها ومجتمع الصحة العامة الدولي من أكثر الأمور التي تثير الاهتمام والقلق على الصحة العامة. تم تطوير هذه التصنيفات من قبل مركز السيطرة على الأمراض والوقاية منها، بالتعاون مع المجموعة المشتركة بين الوكالات (SARS-COV2 ) التي أنشأتها وزارة الصحة والخدمات الإنسانية الأمريكية، لوصف المتغيرات التي تنطوي على زيادة محتملة أو قائمة على أدلة في قابلية الانتقال، أو شدة المرض، أو التداخل مع أهداف الاختبارات التشخيصية، أو انخفاض القابلية لواحد أو أكثر من العلاجات، و/أو انخفاض التحييد بواسطة الأجسام المضادة المتولدة أثناء العدوى أو بعد التطعيم.
هل الموافقة على الطلب مطلوبة؟ لا يوجد
نوع العينة: مسحة البلعوم الأنفي أو الأنف (الفتحات الأمامية) في وسائط النقل الفيروسي
حاوية التجميع: أنبوب بولي بروبيلين مخروطي سعة 15 مل
الحجم الأمثل: > /= 1 مل
إرشادات التجميع:
- استخدم أطقم أدوات التسلسل الخاصة بمتلازمة الالتهاب الرئوي الحاد الوبائي الحاد الوبائيCOV2 ومجموعات الشاحن من الفئة ب لجمع العينات ونقلها
- اكتب بوضوح اسم المريض بالكامل (اسم العائلة والاسم الأول) وتاريخ الميلاد و"أنف" بالنسبة لأنبوب الوسائط الأمامي أو "NP" بالنسبة لنوع المسحة البلعومية الأنفية على ملصق أنبوب الوسائط
- الأنف الأمامي - استخدم مسحة واحدة من عمود بلاستيكي من البوليستر لأخذ عينة من كلا الأنفين، ولا تستخدم القطن
- البلعوم الأنفي - اتبع https://www.cdc.gov/covid/hcp/clinical-care/clinical-specimen-guidelines.html
- توضع المسحة في أنبوب الوسائط المتوفر
- أحكم إغلاق أنبوب الوسائط بإحكام لمنع التسرب وضعه داخل كيس الخطر البيولوجي
- استكمل بدقة استمارة تقديم متلازمة الالتهاب الرئوي الحاد الوبائي الحاد الوبائيCOV2 مع جميع المعلومات ذات الصلة بالمريض
- سبب طلب الاختبار: SARS-COV2 التسلسل، أو أسباب أخرى موضحة في النموذج
- ضع الأعمال الورقية في الحقيبة الخارجية لحقيبة المخاطر البيولوجية، ولا تضع الأعمال الورقية بالداخل مع العينة
يمكن لمقدمي الطلبات المعتمدين من DCLS طلب مجموعات أدوات التجميع على DCLS_SSSKits@dgs.virginia.gov، إذا كانت مجموعة اختبار DCLS متاحة.
حاوية التخزين: أنبوب بولي بروبيلين مخروطي سعة 15 مل
تعليمات التخزين: قم بتخزين العينات مبردة عند درجة 2-8درجة مئوية لنقلها إلى DCLS خلال 72 ساعة، أما العينات التي لا يمكن نقلها خلال هذا الإطار الزمني فيجب تجميدها عند درجة حرارة -70درجة مئوية وشحنها على الثلج الجاف
تعليمات النقل:
- اتبع إرشادات التعبئة والتغليف الخاصة بـ Saf-T-Pak المضمنة في مجموعة أدوات الشحن من الفئة B لإعداد الحاوية
- يجب تضمين عبوتي ثلج مجمدتين في الشحنة
- إذا كانت العينات مجمدة، اشحنها في ثلج جاف
- أحكم إغلاق الصندوق بشريط لاصق للتغليف
- سوف ينسق مركز دبي لخدمات الدعم القانوني والعمل المجتمعي (DCLS) عملية الاستلام بالبريد السريع إذا لم يكن الموقع مخدومًا بشكل روتيني من قبل شركة البريد السريع التابعة لمركز دبي لخدمات الدعم القانوني والعمل المجتمعي
- اتصل ب DCLS على (804)-648-4480 تحويلة. 140 لطلب الاستلام بالبريد السريع من الاثنين - الجمعة من 9:00 صباحًا - 5:00 مساءً
منهجية الاختبار: إثراء ARTIC cDNA وإنشاء مكتبة Illumina DNA الإعدادية. يتم إجراء التسلسل على Illumina MiSeq أو NextSeq 550
معلومات إضافية: يتم تسلسل البيانات التي تم إنشاؤها بواسطة DCLS لأغراض الصحة العامة ولا ينبغي استخدامها بشكل مستقل لاتخاذ قرارات بشأن إدارة رعاية المرضى
أسباب الرفض:
- الكمية غير كافية للاختبار
- عينة موسومة بشكل غير صحيح
- خارج وقت الانتظار
- العينة المستلمة خارج نطاق درجة الحرارة المناسبة
النتائج المحتملة:
- التسلسل غير ناجح
- السلالة المحددة المميزة